Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCOLN1Q9GZU1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCOLN1Q9GZU1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms