Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR12Q9C0I1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms