Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms