Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
LRRCC1Q9C099 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 507.8 ms