Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC2Q9BYS8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC2Q9BYS8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC2Q9BYS8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC2Q9BYS8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC2Q9BYS8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC2Q9BYS8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms