Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTRT3Q9BYD9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTRT3Q9BYD9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTRT3Q9BYD9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTRT3Q9BYD9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTRT3Q9BYD9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTRT3Q9BYD9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTRT3Q9BYD9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTRT3Q9BYD9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTRT3Q9BYD9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTRT3Q9BYD9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTRT3Q9BYD9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTRT3Q9BYD9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTRT3Q9BYD9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTRT3Q9BYD9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTRT3Q9BYD9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTRT3Q9BYD9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTRT3Q9BYD9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTRT3Q9BYD9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTRT3Q9BYD9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTRT3Q9BYD9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTRT3Q9BYD9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTRT3Q9BYD9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTRT3Q9BYD9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTRT3Q9BYD9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTRT3Q9BYD9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTRT3Q9BYD9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTRT3Q9BYD9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTRT3Q9BYD9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTRT3Q9BYD9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTRT3Q9BYD9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms