Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
RNF17Q9BXT8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms