Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms