Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP3Q9BWW4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP3Q9BWW4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP3Q9BWW4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP3Q9BWW4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP3Q9BWW4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP3Q9BWW4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP3Q9BWW4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP3Q9BWW4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP3Q9BWW4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP3Q9BWW4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP3Q9BWW4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP3Q9BWW4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP3Q9BWW4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP3Q9BWW4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP3Q9BWW4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP3Q9BWW4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP3Q9BWW4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP3Q9BWW4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP3Q9BWW4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP3Q9BWW4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP3Q9BWW4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP3Q9BWW4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP3Q9BWW4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP3Q9BWW4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP3Q9BWW4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP3Q9BWW4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP3Q9BWW4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP3Q9BWW4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP3Q9BWW4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP3Q9BWW4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP3Q9BWW4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP3Q9BWW4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP3Q9BWW4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP3Q9BWW4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms