Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
POLR3CQ9BUI4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms