Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms