Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms