Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms