Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF559Q9BR84 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms