Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR11

ZSWIM1, Zinc finger SWIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM1Q9BR11 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZSWIM1Q9BR11 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms