Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SGIP1Q9BQI5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SGIP1Q9BQI5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms