Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
DDX50Q9BQ39 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms