Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTRQ99707 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTRQ99707 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTRQ99707 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTRQ99707 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MTRQ99707 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MTRQ99707 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
MTRQ99707 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MTRQ99707 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTRQ99707 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTRQ99707 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTRQ99707 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MTRQ99707 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTRQ99707 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTRQ99707 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTRQ99707 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTRQ99707 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTRQ99707 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTRQ99707 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MTRQ99707 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTRQ99707 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTRQ99707 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTRQ99707 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTRQ99707 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTRQ99707 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTRQ99707 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTRQ99707 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTRQ99707 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MTRQ99707 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MTRQ99707 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MTRQ99707 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTRQ99707 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTRQ99707 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTRQ99707 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTRQ99707 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTRQ99707 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTRQ99707 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MTRQ99707 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTRQ99707 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTRQ99707 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTRQ99707 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTRQ99707 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTRQ99707 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTRQ99707 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MTRQ99707 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MTRQ99707 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MTRQ99707 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MTRQ99707 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTRQ99707 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTRQ99707 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTRQ99707 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MTRQ99707 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTRQ99707 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTRQ99707 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTRQ99707 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTRQ99707 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTRQ99707 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MTRQ99707 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTRQ99707 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTRQ99707 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTRQ99707 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTRQ99707 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTRQ99707 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTRQ99707 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTRQ99707 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTRQ99707 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTRQ99707 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTRQ99707 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTRQ99707 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTRQ99707 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTRQ99707 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTRQ99707 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTRQ99707 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MTRQ99707 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MTRQ99707 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTRQ99707 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTRQ99707 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTRQ99707 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTRQ99707 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTRQ99707 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTRQ99707 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MTRQ99707 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTRQ99707 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTRQ99707 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTRQ99707 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTRQ99707 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTRQ99707 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTRQ99707 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTRQ99707 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTRQ99707 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTRQ99707 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTRQ99707 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTRQ99707 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTRQ99707 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTRQ99707 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTRQ99707 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MTRQ99707 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MTRQ99707 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MTRQ99707 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTRQ99707 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms