Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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