Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1Q99536 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms