Protein–RNA interactions for Protein: Q99519

NEU1, Sialidase-1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU1Q99519 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NEU1Q99519 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEU1Q99519 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEU1Q99519 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEU1Q99519 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEU1Q99519 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NEU1Q99519 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEU1Q99519 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEU1Q99519 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NEU1Q99519 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEU1Q99519 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEU1Q99519 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEU1Q99519 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEU1Q99519 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEU1Q99519 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEU1Q99519 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NEU1Q99519 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEU1Q99519 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEU1Q99519 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEU1Q99519 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEU1Q99519 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEU1Q99519 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEU1Q99519 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEU1Q99519 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEU1Q99519 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEU1Q99519 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEU1Q99519 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEU1Q99519 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEU1Q99519 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEU1Q99519 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEU1Q99519 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms