Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms