Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms