Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSF3RQ99062 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms