Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SIN3AQ96ST3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms