Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms