Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRAMP1Q96RY5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms