Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALS2CR12Q96Q35 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALS2CR12Q96Q35 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms