Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GBP4Q96PP9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms