Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
ARAP1Q96P48 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ARAP1Q96P48 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
ARAP1Q96P48 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms