Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COG8Q96MW5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG8Q96MW5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms