Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms