Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC138Q96M89 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC138Q96M89 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms