Protein–RNA interactions for Protein: Q96LI5

CNOT6L, CCR4-NOT transcription complex subunit 6-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6LQ96LI5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNOT6LQ96LI5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CNOT6LQ96LI5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CNOT6LQ96LI5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNOT6LQ96LI5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNOT6LQ96LI5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNOT6LQ96LI5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNOT6LQ96LI5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNOT6LQ96LI5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNOT6LQ96LI5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNOT6LQ96LI5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CNOT6LQ96LI5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNOT6LQ96LI5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNOT6LQ96LI5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNOT6LQ96LI5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CNOT6LQ96LI5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNOT6LQ96LI5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNOT6LQ96LI5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNOT6LQ96LI5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNOT6LQ96LI5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNOT6LQ96LI5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNOT6LQ96LI5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNOT6LQ96LI5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNOT6LQ96LI5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms