Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms