Protein–RNA interactions for Protein: Q96JP9

CDHR1, Cadherin-related family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR1Q96JP9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDHR1Q96JP9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDHR1Q96JP9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDHR1Q96JP9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDHR1Q96JP9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDHR1Q96JP9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDHR1Q96JP9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDHR1Q96JP9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDHR1Q96JP9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDHR1Q96JP9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDHR1Q96JP9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDHR1Q96JP9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDHR1Q96JP9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDHR1Q96JP9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDHR1Q96JP9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDHR1Q96JP9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDHR1Q96JP9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDHR1Q96JP9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDHR1Q96JP9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDHR1Q96JP9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDHR1Q96JP9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDHR1Q96JP9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CDHR1Q96JP9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDHR1Q96JP9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CDHR1Q96JP9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDHR1Q96JP9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CDHR1Q96JP9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDHR1Q96JP9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDHR1Q96JP9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDHR1Q96JP9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDHR1Q96JP9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDHR1Q96JP9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms