Protein–RNA interactions for Protein: Q96IY1

NSL1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1Q96IY1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSL1Q96IY1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms