Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BORCS6Q96GS4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms