Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALML4Q96GE6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALML4Q96GE6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms