Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT9

IFT43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT43Q96FT9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms