Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEIL1Q96FI4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEIL1Q96FI4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEIL1Q96FI4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEIL1Q96FI4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NEIL1Q96FI4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEIL1Q96FI4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEIL1Q96FI4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NEIL1Q96FI4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEIL1Q96FI4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEIL1Q96FI4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEIL1Q96FI4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEIL1Q96FI4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEIL1Q96FI4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEIL1Q96FI4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEIL1Q96FI4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEIL1Q96FI4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEIL1Q96FI4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEIL1Q96FI4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEIL1Q96FI4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NEIL1Q96FI4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NEIL1Q96FI4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEIL1Q96FI4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NEIL1Q96FI4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NEIL1Q96FI4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEIL1Q96FI4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEIL1Q96FI4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEIL1Q96FI4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEIL1Q96FI4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEIL1Q96FI4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEIL1Q96FI4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms