Protein–RNA interactions for Protein: Q96DS6

MS4A6E, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6E, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6EQ96DS6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MS4A6EQ96DS6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MS4A6EQ96DS6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MS4A6EQ96DS6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A6EQ96DS6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A6EQ96DS6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A6EQ96DS6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A6EQ96DS6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A6EQ96DS6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A6EQ96DS6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A6EQ96DS6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A6EQ96DS6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A6EQ96DS6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A6EQ96DS6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A6EQ96DS6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A6EQ96DS6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A6EQ96DS6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A6EQ96DS6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A6EQ96DS6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A6EQ96DS6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A6EQ96DS6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A6EQ96DS6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A6EQ96DS6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A6EQ96DS6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A6EQ96DS6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A6EQ96DS6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A6EQ96DS6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A6EQ96DS6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A6EQ96DS6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A6EQ96DS6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms