Protein–RNA interactions for Protein: Q96CK0

ZNF653, Zinc finger protein 653, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF653Q96CK0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF653Q96CK0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF653Q96CK0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms