Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDF1Q96CC6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms