Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF428Q96B54 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF428Q96B54 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF428Q96B54 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF428Q96B54 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF428Q96B54 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF428Q96B54 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF428Q96B54 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF428Q96B54 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF428Q96B54 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
ZNF428Q96B54 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF428Q96B54 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms