Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLDN23Q96B33 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN23Q96B33 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms