Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC74AQ96AQ1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
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