Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM54Q969K7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM54Q969K7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM54Q969K7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM54Q969K7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM54Q969K7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM54Q969K7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM54Q969K7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM54Q969K7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM54Q969K7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM54Q969K7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM54Q969K7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM54Q969K7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM54Q969K7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM54Q969K7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM54Q969K7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM54Q969K7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM54Q969K7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM54Q969K7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM54Q969K7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM54Q969K7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM54Q969K7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM54Q969K7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM54Q969K7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM54Q969K7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM54Q969K7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM54Q969K7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM54Q969K7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM54Q969K7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM54Q969K7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM54Q969K7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM54Q969K7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM54Q969K7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms