Protein–RNA interactions for Protein: Q969H4

CNKSR1, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR1Q969H4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNKSR1Q969H4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms