Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAVIN3Q969G5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN3Q969G5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms